在万国觉醒中切换主将和副将的核心操作需通过部队编辑界面完成。首先确保目标武将已达到三星以上星级，这是解锁副将功能的前提条件。进入部队编辑页面后，主将默认显示在首位，副将位置为次席，点击武将头像即可进行调换。需主将的天赋和技能会完全生效，而副将仅技能生效，天赋不参与战斗计算。这一机制决定了主副将的搭配需以主将天赋为核心，副将技能为补充。
不同武将对不同兵种（步兵、骑兵、弓兵等）存在专属加成，主将的兵种加成直接影响部队整体属性。例如骑兵专精武将作为主将时，搭配步兵专精副将可能导致属性浪费。因此建议优先根据当前部队兵种选择主将，再选择技能互补的副将。游戏内可通过武将详情页查看其兵种加成数据，作为切换决策的依据。
驻防部队的主副将切换规则与野战部队略有不同。点击城墙进入驻防界面后，位于前列的武将被系统默认为主将，后列为副将。驻防状态下主将的驻防天赋会激活，而副将的驻防天赋无效。这种设定要求玩家在防守配置中必须将具有驻防天赋的武将设置为主位。部分武将的特定技能（如孙武的防守减伤）仅在担任主将时才能发挥完整效果。
对于采集部队的配置，采集天赋仅在主将位置生效。这意味着即使副将拥有高级采集技能，若未设置为主将也无法发挥作用。建议将埃及艳后、贞德等采集专精武将固定设置为主将，搭配具有资源负载加成技能的副将。这种组合能最大化采集效率，但需注意采集部队无法像战斗部队那样频繁切换主副将位置，因为每次重新派遣都会重置为默认配置。
高星级武将解锁更多技能槽位，使其在副将位置也能提供关键技能支持。而低星级橙将由于天赋未完全解锁，有时反而不如满星紫将适合担任主将。等级差异则体现在天赋点数分配上，高等级武将通常拥有更完善的天赋树，这也是选择主将时的重要考量因素。游戏后期随着武将培养进度变化，主副将配置需要定期优化调整。
操作层面存在几个常见误区需要避免。其一是误认为副将的技能效果会打折，实际上技能描述数值会完整生效；其二是过度追求橙将组合，忽视紫将的性价比优势；其三是在PVP和PVE场景中使用固定配置，未根据敌方阵容针对性调整主副将顺序。正确的做法是建立多个预设部队模板，针对不同战斗场景快速切换，这能显著提升战斗效率。游戏内虽然没有一键保存配置的功能，但通过固定编队编号可实现类似效果。
